由于公司原因导致员工无法工作，可以扣员工的

可以扣，但有限度。依据《工资支付暂行规定》，扣除工资需按约定，且不超月工资的20%。扣员工有薪假需依法，依据《工资支付暂行规定》第十六条，扣除不得超月工资的20%，超出可能违法。严重影响员工生活，导致员工离职等后果。
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常见方式为协商或按劳动合同约定处理。协商不成，可按劳动合同约定扣除，但要确保合法合规，避免纠纷。选择方式时，需考虑员工实际情况与公司规定，确保双方权益。
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具体操作为：1.了解原因，与员工沟通，明确责任归属；2.依据公司规定与劳动法，决定是否扣有薪假；3.扣除需书面通知员工，并保留证据。若员工有异议，可申请劳动仲裁。